2-巯基-5-二氟甲氧基-1H-苯并咪唑（Ⅰ）和2-氯甲基-3,4-二甲氧基吡啶盐酸盐缩合，生成物（Ⅲ）再用间氯过苯甲酸氧化，即得产物。
1、2-巯甲基-3,4-二甲氧基吡啶的制备
在反应瓶中加入2-氯甲基-3,4-二甲氧基吡啶盐酸盐22.8g、硫脲9.1g和95%乙醇120mL，搅拌回流3h，冷却，再加入2mol/L KOH水溶液120mL，室温搅拌10h，冷却，反应液用氯仿提取。有机相用无水MgSO4干燥，过滤，滤液减压浓缩，得白色固体2-巯甲基-3,4-二甲氧基吡啶15.4g，mp113~115ºC。
2、(3,4-二甲氧基吡啶-2-基)甲硫基甲酸乙酯的制备
在反应瓶中加入2-巯甲基-3,4-二甲氧基吡啶9.5g和二氯甲烷100mL，搅拌溶解，冷却至0ºC，加入氯甲酸乙酯5.7mL和三乙胺8.4mL，室温搅拌5h，反应液用水洗，有机相用无水MgSO4干燥，过滤，滤液减压浓缩得黄色油状物(3,4-二甲氧基吡啶-2-基)甲硫基甲酸乙酯11.8g。
3. 5-二氟甲氧基-2-[(3,4-二甲氧基吡啶-2-基)甲硫基]-1H-苯并咪唑的制备
在反应瓶中加入(3,4-二甲氧基吡啶-2-基)甲硫基甲酸乙酯12.6g、5-二氟甲氧基邻苯二胺12.4g和甲苯100ml,搅拌回流5h.冷却至5ºC以下,析出结晶,抽滤,用甲苯洗涤,抽干,干燥得白色固体5-二氟甲氧基-2-[(3,4-二甲氧基吡啶-2-基)甲硫基]-1H-苯并咪唑16.2g,mp118~119ºC.
4. 泮托拉唑的合成
在反应瓶中加入5-(二氟甲氧基)-2-[(3,4-二甲氧基吡啶-2-基)甲硫基]-1H-苯并咪唑7.4g和二氯甲烷100mL，于冰水浴冷却下，搅拌加入间氯过氧苯甲酸3.5g，室温搅拌反应5h。用10% K2CO3水溶液洗涤，有机相用无水MgSO4干燥，过滤，滤液蒸除溶剂，剩余物用异丙醇重结晶，得白色固体5-(二氟甲氧基)-2-[[(3-二甲氧基-2-吡啶基)甲基]亚磺酰基]-1H-苯并咪唑泮托拉唑7.0g，mp138~139ºC（分解）。
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