肝素可应用于：
血栓栓塞性疾病：肝素可防止血栓的形成和扩大，用于心肌梗死、肺栓塞、脑血管栓塞、外周静脉血管栓塞等。
弥散性血管内凝血：早期静脉注射肝素，可以防止凝血因子的消耗，维持纤维蛋白原和其它凝血因子的数量，防止继发性出血。
可用于体外抗凝，用于输血、血液透析、体外循环的抗凝。
肝素的不良反应与其抗凝血作用有关。人体血液中的凝血和抗凝血、纤溶和抗纤溶系统保持着动态平衡，共同维持血液的流动性。一旦平衡被打破，要么引发血栓栓塞性疾病，要么形成出血性疾病。
因此，应用肝素的不良反应有：出血、血小板减少、氨基转移酶升高、抑制醛固酮合成使血钾升高等。
