肝素可与血小板结合，在血小板输注后短暂降低血小板计数。应用普通肝素也可以激活血小板并释放血小板因子4，这是一种已知的肝素结合蛋白。
它还可以引起抗体形成和血小板减少，这本身就是肝素耐药性的一个已知解释。抗血小板药物的使用会影响全血凝血试验，包括激活凝血时间，导致对肝素的反应性增加，而使血小板快速激活的药物或条件可降低试验对肝素的反应，特别是在接受体外循环的患者中。血小板活性不影响aPTT或抗Xa因子水平。
凝血因子水平升高
在Covid-19和其他急性炎症状态的患者中， VIII 因子和纤维蛋白原水平的增加会缩短 aPTT，并且需要增加普通肝素的剂量以达到目标 aPTT，这表明产生肝素耐药。凝血因子水平的增加不影响抗Xa因子分析。
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